Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP290O15078 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP290O15078 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CEP290O15078 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CEP290O15078 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CEP290O15078 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CEP290O15078 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CEP290O15078 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP290O15078 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP290O15078 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP290O15078 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP290O15078 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP290O15078 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP290O15078 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP290O15078 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP290O15078 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP290O15078 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP290O15078 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP290O15078 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP290O15078 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP290O15078 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP290O15078 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP290O15078 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP290O15078 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP290O15078 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP290O15078 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP290O15078 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP290O15078 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP290O15078 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP290O15078 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP290O15078 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP290O15078 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP290O15078 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP290O15078 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP290O15078 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP290O15078 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP290O15078 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP290O15078 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP290O15078 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP290O15078 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP290O15078 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms