Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLIM4O00461 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GOLIM4O00461 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLIM4O00461 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLIM4O00461 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLIM4O00461 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLIM4O00461 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLIM4O00461 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLIM4O00461 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLIM4O00461 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLIM4O00461 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms