Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3E7EW58 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms