Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms