Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms