Protein–RNA interactions for Protein: A8MTJ6

FOXI3, Forkhead box protein I3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI3A8MTJ6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXI3A8MTJ6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms