Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms