Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms