Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms