Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf51A6NDU8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms