Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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