Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J203

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J203 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0B4J203 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0B4J203 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0B4J203 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0B4J203 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0B4J203 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0B4J203 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0B4J203 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0B4J203 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0B4J203 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0B4J203 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0B4J203 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0B4J203 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0B4J203 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0B4J203 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0B4J203 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J203 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms