Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms