Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms