Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAPGEF2Q9Y4G8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.9 ms