Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNSTRNQ9Y448 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms