Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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