Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNX7Q9UNH6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms