Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms