Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRP68Q9UHB9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRP68Q9UHB9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRP68Q9UHB9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRP68Q9UHB9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRP68Q9UHB9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRP68Q9UHB9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRP68Q9UHB9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRP68Q9UHB9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRP68Q9UHB9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRP68Q9UHB9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRP68Q9UHB9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRP68Q9UHB9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRP68Q9UHB9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRP68Q9UHB9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRP68Q9UHB9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRP68Q9UHB9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRP68Q9UHB9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRP68Q9UHB9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRP68Q9UHB9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRP68Q9UHB9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms