Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms