Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms