Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms