Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms