Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms