Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAPAQ9P0L0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms