Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms