Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms