Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTLNQ9NXG0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms