Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 LINC01513-201ENST00000416930 483 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms