Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms