Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms