Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GLB2Q9NR46 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3GLB2Q9NR46 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3GLB2Q9NR46 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3GLB2Q9NR46 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3GLB2Q9NR46 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3GLB2Q9NR46 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3GLB2Q9NR46 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3GLB2Q9NR46 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3GLB2Q9NR46 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3GLB2Q9NR46 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3GLB2Q9NR46 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3GLB2Q9NR46 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3GLB2Q9NR46 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3GLB2Q9NR46 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3GLB2Q9NR46 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3GLB2Q9NR46 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms