Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC17Q9NP64 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms