Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIN28AQ9H9Z2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms