Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
C11orf49Q9H6J7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C11orf49Q9H6J7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms