Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms