Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms