Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms