Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
YTHDF1Q9BYJ9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms