Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms