Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms