Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP1Q9BWH6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP1Q9BWH6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP1Q9BWH6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP1Q9BWH6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP1Q9BWH6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP1Q9BWH6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP1Q9BWH6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP1Q9BWH6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms