Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms