Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD2Q9BTF0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms