Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms