Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms