Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms