Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms