Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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GFI1Q99684 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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GFI1Q99684 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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GFI1Q99684 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GFI1Q99684 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GFI1Q99684 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GFI1Q99684 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GFI1Q99684 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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GFI1Q99684 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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GFI1Q99684 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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GFI1Q99684 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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GFI1Q99684 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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